MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Simiduia agarivorans SA1 = DSM 21679

Total Repeats: 7534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018868	AAC	2	6	46	51	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018868	AT	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018868	TTTC	2	8	170	177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018868	G	6	6	194	199	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018868	ATG	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018868	ATG	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018868	CTA	2	6	384	389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018868	T	6	6	5379	5384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018868	TCC	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018868	TGAA	2	8	6367	6374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018868	AATATA	2	12	9615	9626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018868	T	6	6	9717	9722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018868	GAAGG	2	10	9727	9736	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018868	TAA	2	6	11069	11074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018868	TAGGG	2	10	11075	11084	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018868	GGT	2	6	11170	11175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018868	ACA	2	6	11184	11189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018868	GAT	2	6	11191	11196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018868	ATG	2	6	11465	11470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018868	TAT	2	6	11545	11550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018868	GC	3	6	11587	11592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018868	GGC	2	6	11639	11644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018868	GCC	2	6	11650	11655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018868	GCG	2	6	11705	11710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018868	AATC	2	8	11711	11718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018868	T	6	6	11766	11771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018868	AAT	2	6	11879	11884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018868	A	6	6	13142	13147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018868	CGGTC	2	10	14039	14048	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_018868	TTA	2	6	14110	14115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018868	GGA	2	6	14210	14215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018868	A	7	7	15556	15562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018868	CGT	2	6	15588	15593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018868	TCC	2	6	16044	16049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_018868	TGT	2	6	17286	17291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018868	TAA	2	6	17324	17329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018868	TAG	2	6	17352	17357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018868	TG	3	6	17377	17382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018868	CTG	2	6	17479	17484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018868	C	6	6	19080	19085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_018868	CAC	2	6	19161	19166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018868	CCA	2	6	19280	19285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018868	A	6	6	19289	19294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018868	T	6	6	19298	19303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018868	TGG	2	6	19307	19312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018868	GCG	2	6	19441	19446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018868	AGGGC	2	10	19519	19528	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018868	AATT	2	8	19578	19585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018868	ATC	2	6	19663	19668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018868	CCT	2	6	20418	20423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018868	GAG	2	6	20429	20434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018868	CGG	2	6	21041	21046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018868	TCA	2	6	21059	21064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018868	ATA	2	6	21072	21077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018868	ATTTT	2	10	21090	21099	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018868	A	6	6	22184	22189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018868	GAG	2	6	22206	22211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018868	CGA	2	6	22236	22241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018868	ACG	2	6	22245	22250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018868	T	7	7	22258	22264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018868	GTT	2	6	22308	22313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018868	CCG	2	6	22345	22350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018868	CAG	2	6	22376	22381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018868	TCCAA	2	10	22772	22781	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_018868	TCCAA	2	10	22788	22797	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_018868	A	6	6	22796	22801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018868	CAGGG	2	10	22821	22830	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018868	T	6	6	24306	24311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018868	TCACC	2	10	24327	24336	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_018868	GT	3	6	24346	24351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018868	TAAA	2	8	27481	27488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018868	A	6	6	27607	27612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018868	GGC	2	6	27613	27618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018868	GCC	2	6	27623	27628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_018868	TGC	2	6	27635	27640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018868	GCT	2	6	31066	31071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018868	AC	3	6	31131	31136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018868	TG	3	6	31147	31152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018868	GGTT	2	8	31198	31205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018868	ACA	2	6	31234	31239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018868	GGC	2	6	33821	33826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018868	AGG	2	6	33883	33888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018868	TAA	2	6	36195	36200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018868	AC	3	6	36201	36206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018868	T	6	6	36208	36213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018868	TGA	2	6	36223	36228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018868	CCG	2	6	36303	36308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018868	GCG	2	6	36367	36372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018868	GTT	2	6	36429	36434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018868	CAGG	2	8	36448	36455	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018868	A	7	7	36458	36464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018868	GGC	2	6	36475	36480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018868	TTG	2	6	38572	38577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018868	CG	3	6	38671	38676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018868	CCTTAG	2	12	41447	41458	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018868	TACT	2	8	44486	44493	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018868	GAA	2	6	44529	44534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018868	GCC	2	6	44585	44590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018868	TGG	2	6	44665	44670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018868	CTA	2	6	44728	44733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018868	TTG	2	6	48002	48007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018868	C	7	7	48091	48097	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_018868	CG	3	6	48105	48110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018868	AGG	2	6	48119	48124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018868	CGG	2	6	48288	48293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018868	AAAC	2	8	48339	48346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018868	GC	3	6	48363	48368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018868	GAA	2	6	48436	48441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018868	A	7	7	49777	49783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018868	T	7	7	49799	49805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018868	T	6	6	49821	49826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018868	CTGG	2	8	49842	49849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018868	TGT	2	6	49911	49916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018868	GGA	2	6	49917	49922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018868	GGT	2	6	53169	53174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018868	TC	3	6	59950	59955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018868	GCA	2	6	59958	59963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018868	ATAA	2	8	60030	60037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018868	TTG	2	6	60078	60083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018868	CTA	2	6	60116	60121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018868	ATGG	2	8	60168	60175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018868	GTT	2	6	60177	60182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018868	TTG	2	6	60199	60204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018868	GGC	2	6	60272	60277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018868	GAA	2	6	60281	60286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018868	TCA	2	6	60300	60305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018868	T	7	7	60333	60339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018868	CTCA	2	8	60344	60351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018868	GGC	2	6	60359	60364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018868	GTT	2	6	61182	61187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018868	G	6	6	61201	61206	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018868	CTG	2	6	61657	61662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018868	CAG	2	6	61670	61675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018868	GGGTG	2	10	62812	62821	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018868	A	7	7	62841	62847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018868	CGA	2	6	62849	62854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018868	GTTG	2	8	62867	62874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018868	GAT	2	6	62916	62921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018868	GTTT	2	8	62963	62970	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018868	GT	3	6	62971	62976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018868	TTG	2	6	63005	63010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018868	AAT	2	6	63129	63134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018868	TC	4	8	63144	63151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018868	CAC	2	6	63157	63162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_018868	TG	3	6	63227	63232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018868	G	6	6	63273	63278	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018868	TTG	2	6	64183	64188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018868	GTA	2	6	64273	64278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018868	A	6	6	64278	64283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018868	GGA	2	6	64373	64378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018868	CATCC	2	10	64420	64429	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
152	NC_018868	T	6	6	66209	66214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018868	ATC	2	6	66220	66225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_018868	TTA	2	6	66278	66283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018868	ATT	2	6	66299	66304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018868	ATTT	2	8	66319	66326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018868	GC	4	8	66371	66378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_018868	TAA	2	6	66385	66390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_018868	GTGGG	2	10	66563	66572	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018868	TGG	2	6	66620	66625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018868	GT	4	8	66637	66644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018868	CCG	2	6	66679	66684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_018868	TGGG	2	8	66733	66740	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018868	ATCA	2	8	66778	66785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_018868	CGGC	2	8	66867	66874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_018868	CGGAC	2	10	66914	66923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
168	NC_018868	TGG	2	6	67035	67040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_018868	T	6	6	67170	67175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018868	TGG	2	6	67200	67205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018868	GCCG	2	8	67221	67228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
174	NC_018868	A	6	6	69095	69100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018868	TAG	2	6	69111	69116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_018868	AAAAT	2	10	73741	73750	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_018868	TGGT	2	8	79232	79239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018868	GAG	3	9	81551	81559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018868	GCC	2	6	84488	84493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_018868	GCG	2	6	84504	84509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_018868	ACT	2	6	90585	90590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_018868	TCG	2	6	92572	92577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_018868	GGT	2	6	92581	92586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_018868	TG	4	8	99923	99930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_018868	TA	4	8	166215	166222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_018868	T	7	7	166323	166329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_018868	GATTA	2	10	166334	166343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_018868	TGG	2	6	166475	166480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_018868	GGCCTG	2	12	259216	259227	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_018868	AAT	2	6	259297	259302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_018868	GGC	2	6	264077	264082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_018868	GTA	2	6	289137	289142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_018868	GTT	2	6	289245	289250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_018868	AT	3	6	289539	289544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_018868	AAG	2	6	289596	289601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_018868	TCTG	2	8	291626	291633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_018868	ATG	2	6	291637	291642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
490	NC_018868	T	6	6	291652	291657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_018868	T	6	6	291665	291670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_018868	GC	3	6	291736	291741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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